Oi Paulo! 

Na previdência complementar existe uma regra que chamamos de "PEPS", que significa: "Primeiro que entra, primeiro que sai". Então, seu entendimento está correto: os R$ 5.000 serão tributados pelos 10%, já que existem contribuições de R$ 10.000 com "maior idade" (mais de 10 anos) no Plano.

Um abraço e uma excelente semana!